澎湖群岛位于台湾海峡中央，由大小六十四个岛屿所组成。由于地表平坦，地形单调，因此岛上生物歧异度低，自然资源有限。然而，复杂变化的海岸地形，景观秀丽的玄武岩，特殊的动植物资源，却也使澎湖跃升为世界的观光旅游胜地。

澎湖地处东南亚候鸟迁移路线的中继站，每年春秋过境期，总有形形色色的候鸟飞临。其中最具特色的要算是燕鸥类了。
每年夏季在猫屿繁殖的燕鸥超过万只以上。望安岛更因绿蠵龟上岸产卵而举世闻名。因此，政府于民国八十年及八十四年公告为『海鸟保护区』、『绿蠵龟产卵栖地保护区』，以保护这些珍贵的燕鸥及绿蠵龟。

北海的鸡善屿、锭钩屿及小白沙屿因玄武岩景观秀丽，也于民国八十一年公告为『玄武岩自然保留区』。
此外澎湖潮间带、鲸豚、植物及珍贵老树的特殊性也孕育出丰富的自然资源及历史典故，更增添了澎湖的生命力与风采。