貓嶼位於澎湖群島的西南方海域，是由大、小貓嶼組成，由海遠眺宛如一隻貓蹲浮在海上而得名，島上處處奇石矗立，四周均被斷崖所圍繞，地形險惡，攀登不易，大貓嶼的最高點海拔７９公尺，更是澎湖群島的最高峰。

貓嶼孤懸外海，地勢陡峭，夏季時，附近海域受黑潮支流影響，漁產豐富，因此成為台灣最大的海鳥繁殖地，其中燕鷗類更高達數萬隻。在經各地保育團體的呼籲及專家實際的調查評估後，於八十年三月十六日經行政院農委會核定，澎湖縣政府八十年五月二十日公告為『貓嶼海鳥保護區』，成為台灣第一個野生動護保護區。

截至目前為止，貓嶼共發現28科75種鳥類。但除夏候鳥燕鷗和留鳥岩鷺外，其餘鳥類大都偶爾經過，或甚至幾年才出現一次。燕鷗又以白眉燕鷗和玄燕鷗數量最多，幾乎佔全部數量的99%。值得一提的是相當稀有的短尾信天翁、黑腳信天翁、大水雉鳥、灰水雉鳥和白腹鰹鳥等也在此出現過。